Scot era alegadamente um astrólogo bastante habilidoso, e tais eram suas habilidades que Frederico II acabou fazendo dele parte de sua corte como seu astrólogo oficial. Durante seu tempo no tribunal, Scott disse ter feito muitas previsões surpreendentes que se tornaram realidade, incluindo o resultado de batalhas e várias calamidades e catástrofes. Seu poder de profecia era tão potente que dizem que ele até predisse sua própria morte. Ele supostamente proclamou que morreria por causa de uma pedra que cairia sobre ele, e tinha tanta certeza disso que sempre usava um capacete onde quer que fosse. Era visto como apenas mais uma de suas muitas excentricidades, e só ficaria claro o quão certo ele estava até 1235, quando ele removeu seu capacete para assistir à missa, e foi atingido por uma pedra caindo do teto na cabeça causando uma doença e sua morte.
Os poderes astrológicos de Scot tornaram-se tão famosos que ele começou a ser creditado por uma série de outras habilidades mágicas. Por exemplo, dizia-se que ele era capaz de induzir visões e ler mentes, obrigar as pessoas a fazerem o que ele quisesse. Suas habilidades com a alquimia também foram bem conhecidas, pois foi dito que Scott podia transformar chumbo em ouro ou fiar corda de areia. Ele era famoso por ser capaz de invocar demônios e espíritos e obrigá-los a cumprir suas ordens. Scot seria mais tarde mencionado como tendo um cajado mágico que poderia separar rios, transformar pessoas em pedra e, até mesmo dividir as colinas de Eildon em três picos, também possuía um corcel mágico levando-o da Escócia para a França em uma única noite. Tal é a sua lenda que ele foi até mencionado em O Inferno de Dante como um escocês banido para o 8º nível do Inferno, um lugar reservado para mágicos e falsos profetas.
Ser retratado como um pecador provavelmente não é tão surpreendente, considerando sua reputação de feiticeiro que o fazia parecer aliado ao Diabo, seu patrono Frederico II precisou excomungá-lo duas vezes e até foi rotulado de Anticristo por pelo menos um Papa.
Durante sua carreira, Scot escreveria inúmeros manuscritos e tratados, cobrindo uma vasta gama de assuntos como ocultismo, esoterismo, astrologia, anatomia humana, fisiologia e reprodução e zoologia, e ele é, sem dúvida, uma pessoa imensamente importante na história.
É interessante que tão pouco se saiba sobre o verdadeiro homem por trás das lendas. Não se sabe exatamente como ou quando ele morreu, embora a lenda diga que ele foi enterrado perto de uma cruz na Abadia de Melrose junto com seus livros de magia.